4 grupta 5'er takımın mücadele edeceği kupada gruplarında ilk 2 sırayı alan takımların yapacağı çeyrek final karşılaşmalarının 3 Şubat 2010 Çarşamba, rövanşı da 10 Şubat 2010 Çarşamba günü oynanacak. Ziraat Türkiye Kupası yarı final ilk maçlarının 24 Mart 2010 Çarşamba, rövanşının ise 14 Nisan 2010 Çarşamba tarihinde yapılması kararlaştırıldı. 2009-2010 sezonunda Ziraat Türkiye Kupası'nı kazanacak takım ise 5 Mayıs 2010 tarihinde oynanacak final maçı ile belli olacak. İŞTE EŞLEŞMELER A GRUBU Tokatspor Altay Antalyaspor Eskişehirspor Fenerbahçe B GRUBU Denizli Belediyespor Orduspor Ankaragücü Galatasaray Trabzonspor C GRUBU Tarsus İdman Yurdu Giresunspor Denizlispor Bursaspor Sivasspor D GRUBU Konya Şekerspor Kasımpaşa Manisaspor İstanbul BŞB Beşiktaş