Yağmurun damga vurduğu yarışı, Ferrari pilotu Fernando Alonso kazandı. Yarışa dokuzuncu sırada başlayan Fernando Alonso, doğru lastik tercihleri ile doğru pist stop stratejileriyle damalı bayrağı ilk sırada gördü. Alonso bu sonucun ardından pilotlar sıralamasında da puanını 35'e çıkardı ve ilk sıraya yükseldi. Yarışta bir diğer sürprizi ise Sergio Perez gerçekleştirdi. Formula 1'de ilk sezonunu geçiren Sauber pilotu Alonso'yu bir ara rahatsız etsede 51'inci turda pist dışına çıktı. Daha sonra yarışa dönen Perez yarışı ikinci sırada tamamlarken 41 sene sonra podyum görmeyi başaran ilk Meksikalı sürücü oldu. Yarışa pole pozisyonda başlayan Lewis Hamilton, startla birlikte öne çıkarken onu McLaren'den takım arkadaşı Jenson Button takip etti. İyi bir start alan Romain Grosjean startla birlikte üçüncü sıraya kadar çıktı. 2010'da Formula 1'e döndükten bu yana en iyi derecesini elde eden ve yarışa ilk sırada başlayan Michael Schumacher ise ikinci turda Grosjean'la hafif bir şekilde çarpıştı. İkiliden Schumacher 16'ıncı, Grosjean ise 18'inci sıraya kadar geriledi. Zaman zaman Muson yağmurlarının etkilediği yarışta ilk fireyi Lotus verdi. Yarışa çok iyi başlamasına karşın önce Schumacher'le çarpışan Grosjean, dördüncü turda spin atarak yarış dışı kaldı. Altıncı turda ise, yoğun yağmurun ardından güvenlik aracı piste girdi. Daha sonra devam eden yarışta, dokuzuncu turda ise yarış askıya alındı. Daha önce 2009'da yaklaşık 30 dakika duran yarış, üç yıl aranın ardından bir kez daha durdu. Yaklaşık 40 dakika ara verilen yarış daha sonra tekrar başlarken, 15'inci turda Jenson Button, Narain Karthikeyan'a arkadan çarptı. button'ın bu hatası onu pite gönderirken, ilk sıralardaki yerini de kaybetmesine neden oldu. Yarışta şanssız bir an yaşayan diğer bir isim ise son iki dünya şampiyonu apoletli Sebastian Vettel oldu. Red Bull pilotu Karthikeyan'ın aracına dokunurken, lastiği patladı ve üçüncü sıradan 12'inci sıraya kadar geriledi. 56 turluk yarışı Fernando Alonso ilk, Sergio Perez ikinci sırada tamamlarken yarışa pole pozisyonda başlayan McLaren pilotu Lewis Hamilton üçüncü oldu. Bu üç ismi Red Bull pilotu Mark Webber, Lotus pilotu Kimi Raikkonen takip etti. Bu beş ismi Williams'tan Bruno Senna, Force İndia'dan Di Resta, Toro Rosso'dan Jergne, Force India'dan Hulkenberg ve Mercedes'ten Michael Schumacher takip ederek, Malezya Grand Prix'sini puanla kapatan isimler oldular.