Komisyon HSYK'nın aldığı geri dönüş kararı ile ilgili an itibariyle açıklama yapmayacaklarını, kararı titizlikle inceleyeceklerini belirttikten sonra "ancak Komisyon'un mezkur konuyu 2006'dan bu yana yakından takip ettiğini ve yıllık ilerleme raporlarında konuyla ilgili değerlendirmeler yaptığını ifade etmek isteriz" dedi. Komisyon, açıklamasında Şemdinli savcısının 2006'da meslekten men edilme kararını "orantısız" olarak nitelendirdiğini vurgularken, o dönemde HSYK'nın diğer devlet kurumlarından "bağımsızlığını" sorguladıklarını belirtti. Açıklamada şöyle denildi: "Komisyon HSYK'nın 2006'da Şemdinli Savcısı olarak tanınan görevliyi meslekten men etme kararını orantısız olarak nitelendirmişti. Ayrıca, o dönemdeki HSYK'nın diğer devlet kurumlarından ne kadar bağımsız olduğuna ilişkin ortaya çıkan soruları da not etmişti". AB Komisyonu, Kasım'da yayınlanan son ilerleme raporunda da Sarıkaya'ya atıf yapmış ve "Davaya bakan sivil savcının meslekten menedilmesi ve Şemdinli Davası'nın şimdiye kadar ele alınış şekli HSYK'nın bağımsızlığı konusunda soru işaretleri üretmiştir" demişti. Komisyon Sarıkaya ile ilgili düştüğü dipnotta ise savcının 2006'da yazdığı iddianamede üst seviyeli askeri yetkilileri itham ettiğini, Genelkurmay'ın "anayasal sorumluluğu olanları göreve davet" etmesinin ardından da savcının HSYK tarafından meslekten menedildiğini hatırlatmıştı.