Ancak sitede dosyaları bulunan ve telife aykırı bir içeriği olmayan kullanıcıların dosyaları da silinme tehlikesiyle karşı karşıya... Olay Megaupload'a hizmet eden sunucu şirketlere ABD'deki Savcılık makamından gelen bir mektupla ortaya çıktı. Mektupta şirketlerin Perşembe gününe kadar Megaupload'a ait verileri silmeye başlayacağı dile getiriliyordu. İşin kötü kısmı, Megaupload'ı kişisel belgeleri için kullananların da dosyalarının silinecek olmasıydı. Yani bir nevi kurunun yanında yaş da yanmış olacaktı. Yine aynı mektuba göre Megauplad'daki verilerin bir kısmının kopyasının ABD hükümetine verileceği de belirtiliyordu. Pek çok kullanıcı için felaket olabilecek bu durum, son dakika hamlesiyle durduruldu; daha doğrusu 2 hafta süresince ertelendi. Megaupload sunucularını barındıran 2 hizmet sağlayıcı ile Megaupload avukatlarının yaptığı anlaşmaya göre, verilen 2 haftadan önce silinmeyecek. Avukatlar, bu süre zarfında yasal mercilerden silme işlemini tamamen durdurmalarını isteyecek.