Maliye Bakanlığı ve Vakıflar Genel Müdürlüğü görevlilerince yapılan incelemede vakfın vergi muafiyeti şartlarını yerine getirmediği tespit edildi. Vakfın vergi muafiyetinin bitirilmesi üzerine dosya Bakanlar Kurulu'na gönderildi. Ergenekon davası çerçevesinde hakkında iddianame hazırlanan Çağdaş Eğitim Vakfı'nın (ÇEV) vergi muafiyeti kaldırılıyor. 28 Şubat döneminde alınan bir kararla 1997 yılından beri bazı vergilerden muaf tutulan vakfın, şartlarını yerine getirmediği gerekçesiyle ayrıcalıklarına son verilecek. Maliye Bakanlığı gelirler kontrolörleri, vakıfta bir denetim yaptı ve vergi muafiyeti şartlarını yerine getirmediğini tespit etti. Bunun üzerine, muafiyetin kaldırılması yönünde onaylarını almak üzere Vakıflar Genel Müdürlüğü'ne bir rapor yazıldı. Vakıflar da bir müfettiş görevlendirerek gerekli teftişi yaptırdı ve aynı neticeye ulaştı. Böylece vakfın vergi konusundaki özel ayrıcalıkları bitirilmek üzere dosya Bakanlar Kurulu'na gönderildi. Kamu yararına çalıştıkları için bazı vakıflara Bakanlar Kurulu kararı ile vergi muafiyeti getiriliyor, özel ayrıcalıklar tanınıyor. Ancak bu, sanılanın aksine, Kurumlar Vergisi'nden muafiyet değil. Çünkü vakıflar, tüzel kişilikleri itibarıyla Kurumlar Vergisi kapsamına girmiyor. Bunun yerine, bazı hizmetleri için Katma Değer Vergisi istisnasından yararlanıyor. Vakfa yapılacak hiçbir bağıştan vergi alınmıyor. Ayrıca, vakfa tahsis olunan mallar için Veraset ve İntikal Vergisi ödemiyor. Gayrimenkulleri için ödemesi gereken harçlardan da muaf tutuluyor ve vakfa ait binalar için Emlak Vergisi muafiyetinden yararlanıyor. Vakıflara, vergi muafiyeti tanınabilmesi için gerekli bazı şartlar var. Örneğin, sağlık, sosyal yardım, eğitim, bilimsel araştırma ve geliştirme, kültür ve çevre koruma ile ağaçlandırma konularında faaliyette bulunması şart. Bunun dışında, bilanço esasına göre defter tutmaları, en az 50 bin lira yıllık gelire sahip olmaları ve brüt gelirlerin en az üçte ikisinin belirlenen alanlarda harcanması gerekiyor. Vakıf yöneticileri Ergenekon kapsamında yargılanıyor - Ergenekon soruşturması kapsamında Çağdaş Yaşamı Destekleme Derneği (ÇYDD) ve Çağdaş Eğitim Vakfı (ÇEV) yöneticilerine yönelik hazırlanan 342 sayfalık iddianame 10 Aralık 2010 tarihinde kabul edildi. Eski ÇEV Başkanı Gülseven Yaşer'in bir numaralı sanık olduğu iddianamede, 8 sanık 7,5 yıldan 19,5 yıla kadar hapisle yargılanıyor. Sanıklar, "Ergenekon terör örgütü üyeliği, devletin güvenliğine ait bilgileri temin etmek, hukuka aykırı olarak kişisel verileri kaydetmek ve özel hayatın gizliliğini ihlal etmek" ile suçlanıyor. Eski ÇEV Genel Başkanı firari Gülseven Yaşer'in, Ergenekon davası sanıklarından Şener Eruygur, Mustafa Balbay, Kemal Alemdaroğlu, Tuncay Özkan ve Tuncer Kılınç gibi birçok isimle örgütsel irtibat ve faaliyette bulunduğu belirtiliyor. İddianameye göre Yaşer, operasyondan haberdar olması üzerine yurtdışına kaçtı. ÇEV, Ergenekon davasında "üst düzey yönetici" iddiasıyla yargılanan emekli Orgeneral Şener Eruygur ve dava sanıklarından emekli Orgeneral Hurşit Tolon'a destek çıkan açıklamalarda bulunmuştu.