Kamuoyunu mağdur eden, ekonomiye tesir eden birçok tartışmalı karara imza atan Danıştay'ın, Sağlık Bakanlığı'nın sahte ilaç satışını engellemek için uygulamaya koyduğu İlaç Takip Sistemi'nin bir parçası olan Karekod sistemini iptal etmesi tartışmaları da beraberinde getirdi. Danıştay, İstanbul Eczacılar Odası'nın açtığı dava üzerine Karekod genelgesinin getirdiği, "1 Haziran'a kadar piyasada karekodsuz ilaç kalmayacak" ibaresini durdurdu. KATSAYI DARBESİ 28 Şubat sürecinde Yüksek Öğretim Kurulu (YÖK) tarafından getirilen Katsayı uygulamasına yönelik bir biriyle çelişen iki farklı karar veren Danıştay eğitim-öğretime büyük darbe vururken, Tüpraş, Galataport, Erdemir'in satışları sürecinde de verdiği kararlarla özelleştirmelerde birçok sorunların yaşanmasına sebep olmuştu. Belediyelerle ilgili olarak Anayasa Mahkemesi'ni bile by-pass eden kararlar alan Danıştay, YARSAV eski Başkanı Ömer Faruk Eminağaoğlu'nun başvurusuyla Adalet Bakanlığı müfettişlerinin hakim kararıyla yaptıkları dinlemelere ilişkin yönetmeliği de iptal etmişti. 29 Mart 2009 Yerel Seçimler öncesi İçişleri Bakanlığı'nın kararı ile nüfusu iki binin altındaki beldelerin belediye kapsamından çıkarılmasına ilişkin kararı Anayasa Mahkemesi tarafından Anayasa'ya uygun bulunurken Danıştay Yüksek Mahkeme'nin bu kararını py-bass etmişti. Bakanlığın söz konusu genelgesini denetleyen Danıştay, yürürlük tarihinin farklı belirlendiği gerekçesiyle düzenlemeyi iptal etmişti. Bu iptal yerel seçimler öncesi birçok karışıklığı da beraberinde getirdi. EMİNAĞAOĞLU FARKI Ergenekon davası'yla ismi ön plana çıkan, sanık ve şüphelilerin avukatlığına soyunduğu izlenimi veren YARSAV eski Başkanı ve Yargıtay Savcısı Ömer Faruk Eminağaoğlu'da Danıştay'ın iptal müdavimleri arasında bulunuyor. Eminağaoğlu tarafından açılan davada Anayasa, Hakimler ve savcılar kanunu ile Ceza Muhakemeleri Kanunu'nun verdiği yetkileri kullanan Adalet Bakanlığı müfettişlerinin hakim kararıyla yaptıkları dinlemelere esas teşkil eden yönetmeliği iptal etmişti. Tartışılan Danıştay kararları # YÖK Başkanı Yusuf Ziya Özcan'ın üniversitelerde başörtüsü sorununun çözümü için üniversite rektörlerine gönderdiği yazıyı "Genelge" gibi değerlendiren Danıştay, bu yazıyı iptal etti. # Ankara'da yol ücretlerine yapılan zammı 2004 yılına geri döndüren kararıyla toplu taşımada kaosa yol açtı. # Sağlık Bakanlığı'nın Doğu ve Güneydoğu Anadolu Bölgesi'ndeki doktor açığını kapatmak için yeniden getirdiği "Zorunlu Görevlendirme" genelgesini iptal etti. # Sigara paketlerindeki uyarı resimleriyle ilgili tebliği durdurarak sigara şirketlerini sevindirmişti. # Sosyal Güvenlik Başkanlığı'nın uzlaşamadığı Türk Eczacılar Birliği'ni by-pass ederek, herbir eczane ile ayrı ayrı sözleşme yapması iptal edildi. # PETKİM, İGDAŞ ve Türkiye Şeker Fabrikaları AŞ ile ilgili alınan özelleştirme kararlarını iptal etti. YENİ ŞAFAK