İddiaya göre ÖSYM'nin hesabına Kuzey Kıbrıs Türk Cumhuriyeti'nden yatırılan sınav ve harç paraları, Türkiye'deki hesaplara aktarılmadı. ÖSYM'de görevli bazı üst düzey bürokratlar, bu paraları örtülü ödenek gibi kullanıp yakınlarının hesabına aktardı. Yapılan araştırmalar sonunda bu paralarla Kıbrıs'ta arsalar alındığı, beş yıldızlı otellerde tatil yapıldığı böylece milyonlarca liralık vurgun yapıldığı iddia edilmişti. Bu iddialar üzerine sayıştay denetçileri harekete geçti. 2009'da Kıbrıs'tan sınava giren adayların ödediği paraların ayrı hesapta tutulması talimatını dönemin YÖK Başkanı Gürüz'ün verdiği ortaya çıktı. İncelemeler sonunda Sayıştay, 1995-2003 yılları arasında iki dönem YÖK başkanlığı yapan Gürüz, KPSS skandalı sonrası istifa eden ÖSYM eski Başkanı Ünal Yarımağan ve diğer ilgililerle ilgili suç duyurusunda bulundu. Suç duyurusu metninde toplanan paraların ayrı bir hesapta tutulmasının suç olduğu belirtildi. Metinde Gürüz'ün imzası ile protokol imzalandığı da yer alıyor. Suç duyurusu üzerine Gürüz, Yarımağan ve diğer ilgililer hakkında soruşturma başlatıldı.