Hava Kuvvetleri Generali Michael Hayden, aralarında CIA'nın bulunduğu 16 istihbarat kuruluşunun bağlı olduğu Ulusal İstihbarat Direktörü John Negroponte'nin yardımcısı olarak çalışıyordu. General Hayden'ın ismi Goss'un istifasından beri Washington kulislerinde dolaşırken, aralarında Cumhuriyetçiler'in de bulunduğu birçok kesimden bu atamaya eleştiri geldi.Hayden, Negroponte ile çalışmadan önce elektronik istihbarattan sorumlu Ulusal Güvenlik Ajansı'nı yönetiyordu. ABD basını, CIA'nın eski Başkanı Porter Goss'un Negroponte ve Hayden'ın Beyaz Saray'da lobi çalışmaları nedeniyle istifa etmek zorunda kaldığını yazmıştı.Amerikan basınında, CIA'nın 11 Eylül 2001'deki terör saldırılarını önleyememesi ve Irak'ta kitle imha silahlarının varlığıyla ilgili ortaya koyulan kanıtlardaki tartışmalı rolünden ötürü özellikle son beş yıldaki imajının bozulduğu ve yeni direktörü zor bir görev beklediği yorumları yapılıyor. Amerikan basınında ayrıca, Başkan George W. Bush'un yaklaşık bir yıl önce istihbarat ağının tümünün denetimini Ulusal İstihbarat Direktörü John Negroponte'ye vermesi ve son gelişmelerin, CIA'nın düzeltilmesi ve ayağa kaldırılması amacına yönelik olduğu belirtilmişti.