9 saattir süren krizi sona erdirmek isteyen Filipin polisi operasyon başlattı. Otobüsün camlarını kıran polis, araca girmeyi başaramadı. Bu sırada içerden açılan bir ateş sonucu bir polis yaralandı. Saldırganın iki rehineyi öldürdüğü iddia ediliyor. Yaklaşık 1 saat süren operasyonda otobüsün içine göz yaşartıcı gaz atıldı. Nefessiz kalan saldırganın başını camdan dışarı çıkarmasıyla birlikte keskin nişancılar saldırganı öldürdü. Kurtarılan rehineler otobüsten tahliye edildi. Manila'da sabah saatlerinde ağır silahlarla silahlanmış eski polis memuru Rolando Mendoza (55), çoğunluğu Hong Konglu turistleri taşıyan otobüsü otobanda durdurarak, 25 kişiyi rehin almıştı. Polisin saldırgan ile yaptığı görüşmeler sonucu aralarında çocuk kadın ve yaşlıların bulunduğu 9 rehine serbest bırakılmıştı. Eski polis memuru olan saldırgan, rehineleri her an öldürebileceğini söylemişti. Filipinler yerel bir radyosuna telefonla saldırgan Mendoza, "Dışarıda çok sayıda özel polis gücü görüyorum. Her yeri sardılar. Beni öldüreceklerini biliyorum. Onlara gitmelerini söylüyorum, yoksa ben de aynısını her an burada yaparım." demişti.