Yaşar Tunagür Hocaefendi yaklaşık 10 yıldır kalp ve koroner arter rahatsızlığı yaşıyordu. Yaşar Tunagür Hocaefendi'nin aynı zamanda şeker ve böbrek hastalıkları da vardı. Son zamanlarda kalp ve solunum rahatsızlıklarının artması üzerine Yaşar Tunagür Hocaefendi bir haftadır İstanbul Dragos Sema Hastanesinde tedavi görüyordu. Sema Hastanesi Başhekimi Doç. Dr. İlyas Akdemir yaptığı açıklamada gece saat 02 sularında kalp ve solunum durması sebebiyle Yaşar Tunagür Hocaefendinin vefat ettiğini söyledi. Yaşar Tunagür Hocaefendi yarın İstanbul Fatih Camiinde öğle namazını müteakip kılınacak cenaze namazının ardından defnedilecek.